Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ascl1Q02067 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ascl1Q02067 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ascl1Q02067 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ascl1Q02067 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ascl1Q02067 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl1Q02067 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ascl1Q02067 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Ascl1Q02067 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ascl1Q02067 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ascl1Q02067 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ascl1Q02067 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ascl1Q02067 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ascl1Q02067 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ascl1Q02067 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ascl1Q02067 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ascl1Q02067 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ascl1Q02067 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ascl1Q02067 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ascl1Q02067 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ascl1Q02067 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ascl1Q02067 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ascl1Q02067 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ascl1Q02067 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ascl1Q02067 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ascl1Q02067 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ascl1Q02067 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms