Protein–RNA interactions for Protein: P97454

Smad5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad5P97454 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad5P97454 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smad5P97454 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad5P97454 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smad5P97454 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smad5P97454 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smad5P97454 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smad5P97454 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Smad5P97454 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Smad5P97454 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad5P97454 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Smad5P97454 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad5P97454 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Smad5P97454 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Smad5P97454 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Smad5P97454 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad5P97454 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Smad5P97454 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Smad5P97454 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Smad5P97454 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad5P97454 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Smad5P97454 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Smad5P97454 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Smad5P97454 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Smad5P97454 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Smad5P97454 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Smad5P97454 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad5P97454 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Smad5P97454 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad5P97454 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smad5P97454 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smad5P97454 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smad5P97454 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad5P97454 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad5P97454 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smad5P97454 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smad5P97454 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Smad5P97454 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad5P97454 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smad5P97454 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad5P97454 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smad5P97454 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smad5P97454 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smad5P97454 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smad5P97454 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smad5P97454 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad5P97454 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smad5P97454 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad5P97454 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smad5P97454 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad5P97454 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Smad5P97454 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Smad5P97454 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Smad5P97454 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad5P97454 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Smad5P97454 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms