Protein–RNA interactions for Protein: P97452

Bop1, Ribosome biogenesis protein BOP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bop1P97452 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Bop1P97452 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Bop1P97452 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Bop1P97452 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Bop1P97452 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bop1P97452 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Bop1P97452 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Bop1P97452 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Bop1P97452 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Bop1P97452 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Bop1P97452 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Bop1P97452 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Bop1P97452 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Bop1P97452 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Bop1P97452 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Bop1P97452 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Bop1P97452 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Bop1P97452 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bop1P97452 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Bop1P97452 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Bop1P97452 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Bop1P97452 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Bop1P97452 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms