Protein–RNA interactions for Protein: P97304

Polr1d, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC2, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1dP97304 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Polr1dP97304 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1dP97304 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Polr1dP97304 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Polr1dP97304 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1dP97304 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Polr1dP97304 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Polr1dP97304 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Polr1dP97304 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Polr1dP97304 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Polr1dP97304 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Polr1dP97304 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Polr1dP97304 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Polr1dP97304 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Polr1dP97304 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Polr1dP97304 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1dP97304 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Polr1dP97304 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Polr1dP97304 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Polr1dP97304 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Polr1dP97304 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Polr1dP97304 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Polr1dP97304 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Polr1dP97304 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Polr1dP97304 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms