Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Trim43bP86448 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim43bP86448 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Trim43bP86448 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Trim43bP86448 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Trim43bP86448 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Trim43bP86448 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim43bP86448 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim43bP86448 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Trim43bP86448 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Trim43bP86448 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Trim43bP86448 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim43bP86448 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim43bP86448 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim43bP86448 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim43bP86448 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim43bP86448 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim43bP86448 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim43bP86448 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim43bP86448 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Trim43bP86448 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim43bP86448 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim43bP86448 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Trim43bP86448 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim43bP86448 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim43bP86448 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim43bP86448 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim43bP86448 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Trim43bP86448 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim43bP86448 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms