Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Lrig1P70193 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Lrig1P70193 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrig1P70193 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Lrig1P70193 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Lrig1P70193 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Lrig1P70193 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig1P70193 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Lrig1P70193 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Lrig1P70193 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrig1P70193 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Lrig1P70193 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lrig1P70193 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Lrig1P70193 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Lrig1P70193 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Lrig1P70193 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Lrig1P70193 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Lrig1P70193 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Lrig1P70193 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrig1P70193 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Lrig1P70193 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Lrig1P70193 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Lrig1P70193 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Lrig1P70193 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrig1P70193 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrig1P70193 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Lrig1P70193 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Lrig1P70193 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Lrig1P70193 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Lrig1P70193 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lrig1P70193 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.7 ms