Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rpl39P62892 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Rpl39P62892 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Rpl39P62892 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rpl39P62892 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rpl39P62892 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpl39P62892 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rpl39P62892 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rpl39P62892 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms