Protein–RNA interactions for Protein: P62482

Kcnab2, Voltage-gated potassium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnab2P62482 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Kcnab2P62482 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnab2P62482 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Kcnab2P62482 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Kcnab2P62482 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Kcnab2P62482 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Kcnab2P62482 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Kcnab2P62482 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcnab2P62482 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Kcnab2P62482 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Kcnab2P62482 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Kcnab2P62482 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Kcnab2P62482 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnab2P62482 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnab2P62482 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Kcnab2P62482 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Kcnab2P62482 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnab2P62482 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Kcnab2P62482 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Kcnab2P62482 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnab2P62482 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Kcnab2P62482 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Kcnab2P62482 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnab2P62482 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Kcnab2P62482 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Kcnab2P62482 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Kcnab2P62482 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Kcnab2P62482 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Kcnab2P62482 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Kcnab2P62482 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kcnab2P62482 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Kcnab2P62482 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Kcnab2P62482 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Kcnab2P62482 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Kcnab2P62482 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms