Protein–RNA interactions for Protein: P61216

Taf13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 124 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf13P61216 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Taf13P61216 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Taf13P61216 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf13P61216 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Taf13P61216 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Taf13P61216 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf13P61216 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Taf13P61216 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Taf13P61216 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Taf13P61216 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Taf13P61216 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Taf13P61216 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf13P61216 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Taf13P61216 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Taf13P61216 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Taf13P61216 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf13P61216 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Taf13P61216 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Taf13P61216 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Taf13P61216 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Taf13P61216 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf13P61216 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Taf13P61216 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Taf13P61216 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Taf13P61216 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Taf13P61216 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Taf13P61216 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf13P61216 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Taf13P61216 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Taf13P61216 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf13P61216 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Taf13P61216 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Taf13P61216 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Taf13P61216 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Taf13P61216 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms