Protein–RNA interactions for Protein: P58465

Ctdspl, CTD small phosphatase-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtdsplP58465 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtdsplP58465 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CtdsplP58465 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CtdsplP58465 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtdsplP58465 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtdsplP58465 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CtdsplP58465 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CtdsplP58465 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtdsplP58465 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CtdsplP58465 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CtdsplP58465 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CtdsplP58465 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CtdsplP58465 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtdsplP58465 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CtdsplP58465 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtdsplP58465 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CtdsplP58465 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CtdsplP58465 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CtdsplP58465 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
CtdsplP58465 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CtdsplP58465 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CtdsplP58465 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CtdsplP58465 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CtdsplP58465 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CtdsplP58465 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtdsplP58465 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtdsplP58465 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CtdsplP58465 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtdsplP58465 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CtdsplP58465 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CtdsplP58465 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CtdsplP58465 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CtdsplP58465 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CtdsplP58465 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtdsplP58465 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtdsplP58465 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtdsplP58465 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CtdsplP58465 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9 ms