Protein–RNA interactions for Protein: P56916

Gsc2, Homeobox protein goosecoid-2, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gsc2P56916 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gsc2P56916 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gsc2P56916 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gsc2P56916 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
Gsc2P56916 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Gsc2P56916 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gsc2P56916 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Gsc2P56916 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gsc2P56916 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Gsc2P56916 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gsc2P56916 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Gsc2P56916 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsc2P56916 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gsc2P56916 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gsc2P56916 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gsc2P56916 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gsc2P56916 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Gsc2P56916 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gsc2P56916 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gsc2P56916 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Gsc2P56916 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gsc2P56916 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gsc2P56916 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Gsc2P56916 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gsc2P56916 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gsc2P56916 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gsc2P56916 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gsc2P56916 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms