Protein–RNA interactions for Protein: P56528

Cd38, ADP-ribosyl cyclase/cyclic ADP-ribose hydrolase 1, mousemouse

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd38P56528 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cd38P56528 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd38P56528 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd38P56528 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd38P56528 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cd38P56528 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cd38P56528 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cd38P56528 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cd38P56528 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Cd38P56528 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd38P56528 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cd38P56528 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd38P56528 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cd38P56528 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cd38P56528 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cd38P56528 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cd38P56528 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cd38P56528 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cd38P56528 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cd38P56528 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Cd38P56528 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Cd38P56528 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Cd38P56528 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Cd38P56528 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Cd38P56528 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd38P56528 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cd38P56528 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Cd38P56528 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd38P56528 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cd38P56528 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd38P56528 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cd38P56528 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd38P56528 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cd38P56528 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cd38P56528 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms