Protein–RNA interactions for Protein: P56477

Irf5, Interferon regulatory factor 5, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf5P56477 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Irf5P56477 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.05■■■□□ 2.56
Irf5P56477 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
Irf5P56477 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Irf5P56477 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Irf5P56477 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Irf5P56477 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Irf5P56477 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Irf5P56477 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Irf5P56477 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Irf5P56477 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Irf5P56477 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
Irf5P56477 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Irf5P56477 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Irf5P56477 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Irf5P56477 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Irf5P56477 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
Irf5P56477 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Irf5P56477 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Irf5P56477 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC30.82■■■□□ 2.52
Irf5P56477 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irf5P56477 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Irf5P56477 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Irf5P56477 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Irf5P56477 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Irf5P56477 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Irf5P56477 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Irf5P56477 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Irf5P56477 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Irf5P56477 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Irf5P56477 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Irf5P56477 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Irf5P56477 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Irf5P56477 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Irf5P56477 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Irf5P56477 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Irf5P56477 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.66■■■□□ 2.5
Irf5P56477 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Irf5P56477 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.64■■■□□ 2.5
Irf5P56477 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Irf5P56477 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Irf5P56477 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
Irf5P56477 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Irf5P56477 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Irf5P56477 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Irf5P56477 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Irf5P56477 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Irf5P56477 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Irf5P56477 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Irf5P56477 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Irf5P56477 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Irf5P56477 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Irf5P56477 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Irf5P56477 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Irf5P56477 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.27■■■□□ 2.44
Irf5P56477 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
Irf5P56477 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Irf5P56477 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Irf5P56477 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Irf5P56477 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30.14■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
Irf5P56477 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Irf5P56477 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms