Protein–RNA interactions for Protein: P55284

Cdh5, Cadherin-5, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh5P55284 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdh5P55284 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdh5P55284 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdh5P55284 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdh5P55284 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdh5P55284 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Cdh5P55284 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Cdh5P55284 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Cdh5P55284 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Cdh5P55284 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh5P55284 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Cdh5P55284 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Cdh5P55284 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh5P55284 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cdh5P55284 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh5P55284 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cdh5P55284 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cdh5P55284 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cdh5P55284 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cdh5P55284 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh5P55284 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cdh5P55284 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cdh5P55284 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cdh5P55284 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms