Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pold1P52431 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pold1P52431 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pold1P52431 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pold1P52431 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pold1P52431 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pold1P52431 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pold1P52431 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pold1P52431 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Pold1P52431 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pold1P52431 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pold1P52431 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pold1P52431 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Pold1P52431 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pold1P52431 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Pold1P52431 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Pold1P52431 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Pold1P52431 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Pold1P52431 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Pold1P52431 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Pold1P52431 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Pold1P52431 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pold1P52431 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pold1P52431 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pold1P52431 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pold1P52431 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pold1P52431 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pold1P52431 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pold1P52431 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pold1P52431 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold1P52431 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold1P52431 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold1P52431 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold1P52431 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold1P52431 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Pold1P52431 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pold1P52431 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pold1P52431 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pold1P52431 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pold1P52431 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pold1P52431 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Pold1P52431 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pold1P52431 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Pold1P52431 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Pold1P52431 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Pold1P52431 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pold1P52431 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms