Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Defa8P50706 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Defa8P50706 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Defa8P50706 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Defa8P50706 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Defa8P50706 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Defa8P50706 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Defa8P50706 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Defa8P50706 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa8P50706 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Defa8P50706 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa8P50706 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Defa8P50706 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Defa8P50706 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa8P50706 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa8P50706 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Defa8P50706 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Defa8P50706 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Defa8P50706 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa8P50706 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Defa8P50706 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa8P50706 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Defa8P50706 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Defa8P50706 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Defa8P50706 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Defa8P50706 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms