Protein–RNA interactions for Protein: P50571

Gabrb1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabrb1P50571 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gabrb1P50571 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gabrb1P50571 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gabrb1P50571 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gabrb1P50571 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gabrb1P50571 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gabrb1P50571 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gabrb1P50571 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabrb1P50571 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabrb1P50571 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gabrb1P50571 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gabrb1P50571 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gabrb1P50571 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gabrb1P50571 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gabrb1P50571 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gabrb1P50571 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gabrb1P50571 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms