Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cav1P49817 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cav1P49817 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cav1P49817 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cav1P49817 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cav1P49817 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cav1P49817 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cav1P49817 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cav1P49817 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cav1P49817 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cav1P49817 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cav1P49817 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cav1P49817 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cav1P49817 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cav1P49817 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cav1P49817 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Cav1P49817 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Cav1P49817 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cav1P49817 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cav1P49817 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cav1P49817 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Cav1P49817 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cav1P49817 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cav1P49817 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Cav1P49817 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cav1P49817 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cav1P49817 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cav1P49817 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Cav1P49817 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cav1P49817 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Cav1P49817 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cav1P49817 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cav1P49817 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Cav1P49817 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cav1P49817 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Cav1P49817 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cav1P49817 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
Cav1P49817 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
Cav1P49817 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cav1P49817 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cav1P49817 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cav1P49817 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cav1P49817 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cav1P49817 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cav1P49817 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms