Protein–RNA interactions for Protein: P49710

Hcls1, Hematopoietic lineage cell-specific protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcls1P49710 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Hcls1P49710 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Hcls1P49710 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Hcls1P49710 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Hcls1P49710 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hcls1P49710 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Hcls1P49710 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hcls1P49710 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Hcls1P49710 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Hcls1P49710 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Hcls1P49710 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Hcls1P49710 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcls1P49710 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Hcls1P49710 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hcls1P49710 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Hcls1P49710 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Hcls1P49710 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Hcls1P49710 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Hcls1P49710 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcls1P49710 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcls1P49710 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Hcls1P49710 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Hcls1P49710 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Hcls1P49710 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Hcls1P49710 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Hcls1P49710 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Hcls1P49710 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms