Protein–RNA interactions for Protein: P46467

Vps4b, Vacuolar protein sorting-associated protein 4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4bP46467 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vps4bP46467 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps4bP46467 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vps4bP46467 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps4bP46467 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps4bP46467 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps4bP46467 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps4bP46467 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vps4bP46467 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Vps4bP46467 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Vps4bP46467 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vps4bP46467 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps4bP46467 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vps4bP46467 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps4bP46467 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Vps4bP46467 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Vps4bP46467 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Vps4bP46467 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Vps4bP46467 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps4bP46467 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Vps4bP46467 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Vps4bP46467 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Vps4bP46467 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Vps4bP46467 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Vps4bP46467 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps4bP46467 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps4bP46467 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps4bP46467 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps4bP46467 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps4bP46467 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps4bP46467 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps4bP46467 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms