Protein–RNA interactions for Protein: P43300

Egr3, Early growth response protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr3P43300 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr3P43300 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Egr3P43300 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Egr3P43300 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Egr3P43300 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egr3P43300 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Egr3P43300 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Egr3P43300 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Egr3P43300 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Egr3P43300 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Egr3P43300 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Egr3P43300 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Egr3P43300 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Egr3P43300 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Egr3P43300 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Egr3P43300 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Egr3P43300 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Egr3P43300 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Egr3P43300 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Egr3P43300 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Egr3P43300 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Egr3P43300 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Egr3P43300 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms