Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msh2P43247 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Msh2P43247 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Msh2P43247 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Msh2P43247 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Msh2P43247 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Msh2P43247 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Msh2P43247 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Msh2P43247 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Msh2P43247 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Msh2P43247 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Msh2P43247 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Msh2P43247 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Msh2P43247 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Msh2P43247 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Msh2P43247 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Msh2P43247 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Msh2P43247 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Msh2P43247 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Msh2P43247 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msh2P43247 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msh2P43247 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Msh2P43247 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Msh2P43247 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Msh2P43247 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Msh2P43247 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Msh2P43247 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Msh2P43247 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Msh2P43247 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Msh2P43247 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Msh2P43247 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Msh2P43247 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Msh2P43247 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Msh2P43247 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Msh2P43247 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 97.1 ms