Protein–RNA interactions for Protein: P38647

Hspa9, Stress-70 protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 679 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hspa9P38647 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Hspa9P38647 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Hspa9P38647 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Hspa9P38647 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hspa9P38647 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Hspa9P38647 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Hspa9P38647 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Hspa9P38647 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hspa9P38647 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Hspa9P38647 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Hspa9P38647 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hspa9P38647 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hspa9P38647 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hspa9P38647 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Hspa9P38647 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hspa9P38647 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hspa9P38647 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hspa9P38647 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hspa9P38647 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hspa9P38647 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hspa9P38647 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hspa9P38647 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hspa9P38647 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Hspa9P38647 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Hspa9P38647 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Hspa9P38647 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Hspa9P38647 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Hspa9P38647 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Hspa9P38647 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Hspa9P38647 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspa9P38647 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Hspa9P38647 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms