Protein–RNA interactions for Protein: P35639

Ddit3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddit3P35639 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
Ddit3P35639 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
Ddit3P35639 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
Ddit3P35639 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ddit3P35639 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ddit3P35639 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Ddit3P35639 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Ddit3P35639 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Ddit3P35639 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ddit3P35639 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Ddit3P35639 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Ddit3P35639 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ddit3P35639 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Ddit3P35639 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
Ddit3P35639 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Ddit3P35639 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Ddit3P35639 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ddit3P35639 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Ddit3P35639 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
Ddit3P35639 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Ddit3P35639 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Ddit3P35639 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Ddit3P35639 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Ddit3P35639 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ddit3P35639 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Ddit3P35639 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Ddit3P35639 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Ddit3P35639 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Ddit3P35639 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Ddit3P35639 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ddit3P35639 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Ddit3P35639 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Ddit3P35639 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Ddit3P35639 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Ddit3P35639 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Ddit3P35639 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Ddit3P35639 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ddit3P35639 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Ddit3P35639 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.6■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Ddit3P35639 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Ddit3P35639 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ddit3P35639 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.55■■■□□ 2.48
Ddit3P35639 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Ddit3P35639 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
Ddit3P35639 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC30.42■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Ddit3P35639 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms