Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kif3aP28741 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Kif3aP28741 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29.98■■■□□ 2.39
Kif3aP28741 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC29.92■■■□□ 2.38
Kif3aP28741 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Kif3aP28741 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Kif3aP28741 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Kif3aP28741 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kif3aP28741 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kif3aP28741 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Kif3aP28741 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Kif3aP28741 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Kif3aP28741 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kif3aP28741 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kif3aP28741 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Kif3aP28741 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
Kif3aP28741 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Kif3aP28741 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Kif3aP28741 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Kif3aP28741 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kif3aP28741 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Kif3aP28741 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Kif3aP28741 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kif3aP28741 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Kif3aP28741 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Kif3aP28741 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Kif3aP28741 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Kif3aP28741 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Kif3aP28741 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Kif3aP28741 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
Kif3aP28741 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Kif3aP28741 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Kif3aP28741 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms