Protein–RNA interactions for Protein: P28738

Kif5c, Kinesin heavy chain isoform 5C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif5cP28738 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Kif5cP28738 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Kif5cP28738 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Kif5cP28738 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Kif5cP28738 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Kif5cP28738 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Kif5cP28738 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Kif5cP28738 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,99■■□□□ 1,91
Kif5cP28738 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Kif5cP28738 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,98■■□□□ 1,91
Kif5cP28738 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Kif5cP28738 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,91■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,9■■□□□ 1,9
Kif5cP28738 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Kif5cP28738 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Kif5cP28738 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Kif5cP28738 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Kif5cP28738 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Kif5cP28738 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,77■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,76■■□□□ 1,88
Kif5cP28738 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Kif5cP28738 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26,69■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,65■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26,65■■□□□ 1,86
Kif5cP28738 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Kif5cP28738 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,54■■□□□ 1,84
Kif5cP28738 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26,54■■□□□ 1,84
Kif5cP28738 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Kif5cP28738 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Kif5cP28738 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Kif5cP28738 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Kif5cP28738 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Kif5cP28738 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Kif5cP28738 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,47■■□□□ 1,83
Kif5cP28738 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26,45■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,44■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,43■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Kif5cP28738 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,38■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,38■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Kif5cP28738 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26,32■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Kif5cP28738 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms