Protein–RNA interactions for Protein: P28654

Dcn, Decorin, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DcnP28654 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcnP28654 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
DcnP28654 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
DcnP28654 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcnP28654 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
DcnP28654 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcnP28654 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
DcnP28654 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
DcnP28654 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
DcnP28654 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
DcnP28654 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DcnP28654 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DcnP28654 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcnP28654 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DcnP28654 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcnP28654 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcnP28654 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DcnP28654 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcnP28654 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DcnP28654 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DcnP28654 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
DcnP28654 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
DcnP28654 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcnP28654 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
DcnP28654 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
DcnP28654 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcnP28654 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcnP28654 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
DcnP28654 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcnP28654 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcnP28654 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
DcnP28654 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcnP28654 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcnP28654 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
DcnP28654 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcnP28654 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
DcnP28654 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcnP28654 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
DcnP28654 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
DcnP28654 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
DcnP28654 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
DcnP28654 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcnP28654 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DcnP28654 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DcnP28654 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcnP28654 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DcnP28654 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DcnP28654 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
DcnP28654 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DcnP28654 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DcnP28654 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DcnP28654 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcnP28654 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DcnP28654 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DcnP28654 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcnP28654 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcnP28654 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DcnP28654 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DcnP28654 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DcnP28654 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcnP28654 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcnP28654 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DcnP28654 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DcnP28654 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcnP28654 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DcnP28654 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
DcnP28654 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DcnP28654 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DcnP28654 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcnP28654 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DcnP28654 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
DcnP28654 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DcnP28654 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DcnP28654 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DcnP28654 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcnP28654 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcnP28654 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
DcnP28654 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
DcnP28654 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcnP28654 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
DcnP28654 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
DcnP28654 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcnP28654 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
DcnP28654 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
DcnP28654 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
DcnP28654 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcnP28654 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
DcnP28654 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms