Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd9P28357 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Hoxd9P28357 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Hoxd9P28357 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Hoxd9P28357 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Hoxd9P28357 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Hoxd9P28357 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Hoxd9P28357 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Hoxd9P28357 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Hoxd9P28357 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Hoxd9P28357 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hoxd9P28357 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hoxd9P28357 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hoxd9P28357 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hoxd9P28357 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hoxd9P28357 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hoxd9P28357 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd9P28357 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hoxd9P28357 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Hoxd9P28357 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Hoxd9P28357 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Hoxd9P28357 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Hoxd9P28357 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Hoxd9P28357 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd9P28357 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Hoxd9P28357 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Hoxd9P28357 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Hoxd9P28357 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Hoxd9P28357 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Hoxd9P28357 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Hoxd9P28357 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms