Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RdxP26043 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
RdxP26043 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
RdxP26043 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
RdxP26043 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RdxP26043 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
RdxP26043 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RdxP26043 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
RdxP26043 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
RdxP26043 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RdxP26043 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
RdxP26043 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
RdxP26043 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
RdxP26043 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
RdxP26043 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RdxP26043 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
RdxP26043 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
RdxP26043 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
RdxP26043 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RdxP26043 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RdxP26043 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RdxP26043 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
RdxP26043 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RdxP26043 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RdxP26043 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RdxP26043 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RdxP26043 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RdxP26043 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RdxP26043 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RdxP26043 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RdxP26043 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RdxP26043 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RdxP26043 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RdxP26043 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RdxP26043 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RdxP26043 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RdxP26043 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
RdxP26043 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RdxP26043 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
RdxP26043 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
RdxP26043 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
RdxP26043 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
RdxP26043 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RdxP26043 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RdxP26043 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
RdxP26043 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
RdxP26043 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RdxP26043 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
RdxP26043 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
RdxP26043 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
RdxP26043 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
RdxP26043 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RdxP26043 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RdxP26043 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
RdxP26043 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
RdxP26043 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
RdxP26043 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RdxP26043 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RdxP26043 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RdxP26043 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RdxP26043 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RdxP26043 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RdxP26043 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
RdxP26043 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
RdxP26043 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
RdxP26043 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RdxP26043 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
RdxP26043 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RdxP26043 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RdxP26043 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
RdxP26043 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
RdxP26043 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
RdxP26043 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
RdxP26043 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
RdxP26043 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RdxP26043 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RdxP26043 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RdxP26043 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RdxP26043 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RdxP26043 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
RdxP26043 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RdxP26043 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
RdxP26043 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RdxP26043 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
RdxP26043 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
RdxP26043 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RdxP26043 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
RdxP26043 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RdxP26043 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
RdxP26043 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
RdxP26043 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
RdxP26043 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RdxP26043 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
RdxP26043 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RdxP26043 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RdxP26043 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RdxP26043 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
RdxP26043 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RdxP26043 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
RdxP26043 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms