Protein–RNA interactions for Protein: P25425

Pou2f1, POU domain, class 2, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou2f1P25425 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pou2f1P25425 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pou2f1P25425 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Pou2f1P25425 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pou2f1P25425 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pou2f1P25425 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou2f1P25425 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou2f1P25425 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pou2f1P25425 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pou2f1P25425 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pou2f1P25425 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pou2f1P25425 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pou2f1P25425 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pou2f1P25425 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Pou2f1P25425 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pou2f1P25425 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pou2f1P25425 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pou2f1P25425 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou2f1P25425 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pou2f1P25425 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Pou2f1P25425 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pou2f1P25425 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pou2f1P25425 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pou2f1P25425 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Pou2f1P25425 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms