Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Rps6ka1P18653 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Rps6ka1P18653 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6ka1P18653 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Rps6ka1P18653 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6ka1P18653 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6ka1P18653 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Rps6ka1P18653 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Rps6ka1P18653 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Rps6ka1P18653 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Rps6ka1P18653 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rps6ka1P18653 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Rps6ka1P18653 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rps6ka1P18653 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
Rps6ka1P18653 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
Rps6ka1P18653 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rps6ka1P18653 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Rps6ka1P18653 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Rps6ka1P18653 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Rps6ka1P18653 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6ka1P18653 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Rps6ka1P18653 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Rps6ka1P18653 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rps6ka1P18653 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Rps6ka1P18653 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rps6ka1P18653 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Rps6ka1P18653 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Rps6ka1P18653 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Rps6ka1P18653 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rps6ka1P18653 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Rps6ka1P18653 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rps6ka1P18653 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Rps6ka1P18653 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rps6ka1P18653 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms