Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Irf1P15314 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Irf1P15314 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Irf1P15314 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf1P15314 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Irf1P15314 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf1P15314 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Irf1P15314 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Irf1P15314 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf1P15314 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Irf1P15314 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Irf1P15314 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Irf1P15314 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf1P15314 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Irf1P15314 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Irf1P15314 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Irf1P15314 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Irf1P15314 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf1P15314 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Irf1P15314 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Irf1P15314 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Irf1P15314 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf1P15314 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Irf1P15314 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf1P15314 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Irf1P15314 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Irf1P15314 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irf1P15314 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf1P15314 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf1P15314 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Irf1P15314 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf1P15314 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irf1P15314 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf1P15314 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irf1P15314 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf1P15314 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irf1P15314 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irf1P15314 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irf1P15314 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irf1P15314 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf1P15314 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Irf1P15314 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 753.5 ms