Protein–RNA interactions for Protein: P15089

Cpa3, Mast cell carboxypeptidase A, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpa3P15089 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Cpa3P15089 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Cpa3P15089 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Cpa3P15089 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpa3P15089 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpa3P15089 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Cpa3P15089 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Cpa3P15089 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Cpa3P15089 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Cpa3P15089 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Cpa3P15089 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Cpa3P15089 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cpa3P15089 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa3P15089 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cpa3P15089 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cpa3P15089 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cpa3P15089 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpa3P15089 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cpa3P15089 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa3P15089 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa3P15089 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa3P15089 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cpa3P15089 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cpa3P15089 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cpa3P15089 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpa3P15089 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cpa3P15089 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cpa3P15089 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Cpa3P15089 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cpa3P15089 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cpa3P15089 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms