Protein–RNA interactions for Protein: P12672

Rapsn, 43 kDa receptor-associated protein of the synapse, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RapsnP12672 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RapsnP12672 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RapsnP12672 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RapsnP12672 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RapsnP12672 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RapsnP12672 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RapsnP12672 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RapsnP12672 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
RapsnP12672 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RapsnP12672 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RapsnP12672 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
RapsnP12672 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RapsnP12672 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RapsnP12672 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RapsnP12672 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RapsnP12672 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RapsnP12672 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
RapsnP12672 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RapsnP12672 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RapsnP12672 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RapsnP12672 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RapsnP12672 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RapsnP12672 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RapsnP12672 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RapsnP12672 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RapsnP12672 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RapsnP12672 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
RapsnP12672 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms