Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PolP11369 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PolP11369 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PolP11369 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PolP11369 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
PolP11369 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PolP11369 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PolP11369 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PolP11369 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PolP11369 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PolP11369 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PolP11369 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PolP11369 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PolP11369 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PolP11369 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PolP11369 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PolP11369 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PolP11369 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PolP11369 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PolP11369 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PolP11369 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PolP11369 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PolP11369 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PolP11369 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PolP11369 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PolP11369 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PolP11369 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PolP11369 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PolP11369 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PolP11369 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolP11369 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolP11369 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
PolP11369 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
PolP11369 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PolP11369 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PolP11369 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PolP11369 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolP11369 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolP11369 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolP11369 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PolP11369 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
PolP11369 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
PolP11369 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PolP11369 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
PolP11369 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
PolP11369 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PolP11369 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
PolP11369 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
PolP11369 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolP11369 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolP11369 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
PolP11369 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
PolP11369 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
PolP11369 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
PolP11369 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
PolP11369 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
PolP11369 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PolP11369 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PolP11369 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PolP11369 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PolP11369 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PolP11369 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PolP11369 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PolP11369 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PolP11369 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PolP11369 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
PolP11369 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PolP11369 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
PolP11369 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PolP11369 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolP11369 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolP11369 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PolP11369 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolP11369 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PolP11369 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolP11369 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PolP11369 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolP11369 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PolP11369 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolP11369 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolP11369 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PolP11369 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PolP11369 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PolP11369 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PolP11369 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PolP11369 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PolP11369 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PolP11369 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PolP11369 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PolP11369 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PolP11369 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PolP11369 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PolP11369 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PolP11369 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PolP11369 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PolP11369 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PolP11369 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PolP11369 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PolP11369 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PolP11369 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms