Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q1

Ccdc153, Coiled-coil domain-containing protein 153, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc153P0C7Q1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc153P0C7Q1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc153P0C7Q1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc153P0C7Q1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc153P0C7Q1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc153P0C7Q1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ccdc153P0C7Q1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ccdc153P0C7Q1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ccdc153P0C7Q1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc153P0C7Q1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ccdc153P0C7Q1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc153P0C7Q1 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ccdc153P0C7Q1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc153P0C7Q1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc153P0C7Q1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Ccdc153P0C7Q1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ccdc153P0C7Q1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ccdc153P0C7Q1 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccdc153P0C7Q1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms