Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf6P0C6B7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Igsf6P0C6B7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Igsf6P0C6B7 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Igsf6P0C6B7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Igsf6P0C6B7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf6P0C6B7 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Igsf6P0C6B7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Igsf6P0C6B7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Igsf6P0C6B7 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Igsf6P0C6B7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Igsf6P0C6B7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Igsf6P0C6B7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Igsf6P0C6B7 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Igsf6P0C6B7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Igsf6P0C6B7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Igsf6P0C6B7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Igsf6P0C6B7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Igsf6P0C6B7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms