Protein–RNA interactions for Protein: P09026

Hoxb3, Homeobox protein Hox-B3, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb3P09026 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Hoxb3P09026 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,86
Hoxb3P09026 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26,67■■□□□ 1,86
Hoxb3P09026 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
Hoxb3P09026 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26,65■■□□□ 1,86
Hoxb3P09026 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Hoxb3P09026 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
Hoxb3P09026 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Hoxb3P09026 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Hoxb3P09026 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Hoxb3P09026 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26,56■■□□□ 1,84
Hoxb3P09026 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Hoxb3P09026 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Hoxb3P09026 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Hoxb3P09026 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26,52■■□□□ 1,84
Hoxb3P09026 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,48■■□□□ 1,83
Hoxb3P09026 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Hoxb3P09026 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Hoxb3P09026 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,37■■□□□ 1,81
Hoxb3P09026 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxb3P09026 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxb3P09026 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Hoxb3P09026 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Hoxb3P09026 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Hoxb3P09026 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxb3P09026 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxb3P09026 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Hoxb3P09026 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26,27■■□□□ 1,8
Hoxb3P09026 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Hoxb3P09026 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,18■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26,16■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,14■■□□□ 1,78
Hoxb3P09026 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26,09■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Hoxb3P09026 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Hoxb3P09026 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,05■■□□□ 1,76
Hoxb3P09026 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Hoxb3P09026 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Hoxb3P09026 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Hoxb3P09026 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25,97■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,97■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,95■■□□□ 1,75
Hoxb3P09026 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25,95■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,93■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25,91■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Hoxb3P09026 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Hoxb3P09026 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Hoxb3P09026 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25,8■■□□□ 1,72
Hoxb3P09026 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Hoxb3P09026 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,76■■□□□ 1,71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,7 ms