Protein–RNA interactions for Protein: P06344

H-2 class II histocompatibility antigen, A-U beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06344 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
P06344 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
P06344 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
P06344 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P06344 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
P06344 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
P06344 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
P06344 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P06344 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
P06344 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
P06344 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
P06344 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
P06344 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
P06344 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
P06344 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
P06344 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
P06344 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P06344 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
P06344 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
P06344 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
P06344 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
P06344 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
P06344 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
P06344 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
P06344 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
P06344 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
P06344 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
P06344 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P06344 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
P06344 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P06344 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
P06344 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
P06344 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P06344 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
P06344 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
P06344 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
P06344 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
P06344 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
P06344 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
P06344 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P06344 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
P06344 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
P06344 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
P06344 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
P06344 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
P06344 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
P06344 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
P06344 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
P06344 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
P06344 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
P06344 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
P06344 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06344 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
P06344 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P06344 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
P06344 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
P06344 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
P06344 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
P06344 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06344 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
P06344 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06344 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
P06344 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
P06344 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06344 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06344 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
P06344 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
P06344 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
P06344 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
P06344 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
P06344 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
P06344 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
P06344 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06344 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06344 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
P06344 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
P06344 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06344 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06344 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
P06344 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
P06344 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06344 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
P06344 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
P06344 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
P06344 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
P06344 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
P06344 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06344 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
P06344 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
P06344 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P06344 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
P06344 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06344 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06344 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
P06344 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
P06344 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
P06344 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
P06344 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
P06344 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
P06344 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms