Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ItgamP05555 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ItgamP05555 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ItgamP05555 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ItgamP05555 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgamP05555 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ItgamP05555 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ItgamP05555 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgamP05555 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ItgamP05555 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ItgamP05555 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgamP05555 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ItgamP05555 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgamP05555 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgamP05555 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ItgamP05555 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
ItgamP05555 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ItgamP05555 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ItgamP05555 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ItgamP05555 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ItgamP05555 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgamP05555 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgamP05555 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ItgamP05555 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ItgamP05555 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ItgamP05555 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ItgamP05555 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ItgamP05555 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgamP05555 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgamP05555 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgamP05555 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgamP05555 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgamP05555 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgamP05555 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgamP05555 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.4 ms