Protein–RNA interactions for Protein: P01789

Ig heavy chain V region M603, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01789 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01789 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01789 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20,24■□□□□ 0,83
P01789 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
P01789 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,22■□□□□ 0,83
P01789 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
P01789 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,21■□□□□ 0,83
P01789 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,19■□□□□ 0,82
P01789 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC20,19■□□□□ 0,82
P01789 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20,19■□□□□ 0,82
P01789 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,17■□□□□ 0,82
P01789 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01789 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,16■□□□□ 0,82
P01789 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01789 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01789 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,15■□□□□ 0,82
P01789 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,14■□□□□ 0,81
P01789 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC20,14■□□□□ 0,81
P01789 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01789 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,13■□□□□ 0,81
P01789 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,12■□□□□ 0,81
P01789 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC20,11■□□□□ 0,81
P01789 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
P01789 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,11■□□□□ 0,81
P01789 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20,1■□□□□ 0,81
P01789 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,1■□□□□ 0,81
P01789 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01789 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01789 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,09■□□□□ 0,81
P01789 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20,07■□□□□ 0,8
P01789 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
P01789 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
P01789 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,06■□□□□ 0,8
P01789 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,05■□□□□ 0,8
P01789 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20,04■□□□□ 0,8
P01789 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20,04■□□□□ 0,8
P01789 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
P01789 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
P01789 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
P01789 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20,02■□□□□ 0,8
P01789 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,8
P01789 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC20,02■□□□□ 0,8
P01789 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,02■□□□□ 0,79
P01789 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
P01789 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,01■□□□□ 0,79
P01789 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0,79
P01789 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
P01789 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
P01789 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0,79
P01789 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
P01789 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,99■□□□□ 0,79
P01789 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19,98■□□□□ 0,79
P01789 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
P01789 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,97■□□□□ 0,79
P01789 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19,96■□□□□ 0,79
P01789 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,96■□□□□ 0,79
P01789 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
P01789 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
P01789 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
P01789 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19,95■□□□□ 0,78
P01789 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19,94■□□□□ 0,78
P01789 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
P01789 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,93■□□□□ 0,78
P01789 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
P01789 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19,92■□□□□ 0,78
P01789 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,92■□□□□ 0,78
P01789 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,91■□□□□ 0,78
P01789 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19,91■□□□□ 0,78
P01789 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC19,91■□□□□ 0,78
P01789 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,89■□□□□ 0,77
P01789 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19,88■□□□□ 0,77
P01789 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,87■□□□□ 0,77
P01789 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,85■□□□□ 0,77
P01789 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,83■□□□□ 0,76
P01789 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
P01789 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19,82■□□□□ 0,76
P01789 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19,79■□□□□ 0,76
P01789 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
P01789 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
P01789 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19,78■□□□□ 0,76
P01789 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P01789 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P01789 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,77■□□□□ 0,76
P01789 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
P01789 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,76■□□□□ 0,75
P01789 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,76■□□□□ 0,75
P01789 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
P01789 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19,75■□□□□ 0,75
P01789 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
P01789 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19,75■□□□□ 0,75
P01789 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19,74■□□□□ 0,75
P01789 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,73■□□□□ 0,75
P01789 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19,72■□□□□ 0,75
P01789 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,72■□□□□ 0,75
P01789 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
P01789 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,7■□□□□ 0,74
P01789 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,69■□□□□ 0,74
P01789 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,68■□□□□ 0,74
P01789 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
P01789 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,67■□□□□ 0,74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms