Protein–RNA interactions for Protein: P01674

Ig kappa chain V-III region PC 2154, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01674 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01674 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
P01674 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
P01674 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P01674 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
P01674 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
P01674 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01674 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01674 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01674 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
P01674 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
P01674 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01674 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
P01674 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
P01674 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01674 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
P01674 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
P01674 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01674 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
P01674 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
P01674 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
P01674 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
P01674 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
P01674 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01674 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
P01674 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
P01674 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01674 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01674 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
P01674 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
P01674 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
P01674 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01674 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
P01674 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01674 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01674 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01674 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
P01674 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01674 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
P01674 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
P01674 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01674 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01674 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01674 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
P01674 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01674 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01674 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01674 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
P01674 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01674 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
P01674 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
P01674 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
P01674 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
P01674 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
P01674 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01674 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01674 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
P01674 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
P01674 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
P01674 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01674 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01674 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
P01674 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
P01674 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
P01674 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
P01674 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
P01674 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01674 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
P01674 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01674 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01674 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
P01674 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01674 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
P01674 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01674 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01674 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01674 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
P01674 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
P01674 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01674 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01674 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
P01674 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
P01674 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01674 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
P01674 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01674 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
P01674 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01674 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
P01674 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
P01674 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
P01674 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
P01674 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01674 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
P01674 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms