Protein–RNA interactions for Protein: O89016

Abcd4, ATP-binding cassette sub-family D member 4, mousemouse

Predictions only

Length 606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd4O89016 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Abcd4O89016 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcd4O89016 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcd4O89016 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcd4O89016 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcd4O89016 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcd4O89016 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcd4O89016 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcd4O89016 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcd4O89016 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcd4O89016 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Abcd4O89016 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd4O89016 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Abcd4O89016 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Abcd4O89016 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Abcd4O89016 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd4O89016 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Abcd4O89016 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Abcd4O89016 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Abcd4O89016 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd4O89016 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Abcd4O89016 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Abcd4O89016 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Abcd4O89016 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Abcd4O89016 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms