Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
F11rO88792 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F11rO88792 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F11rO88792 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
F11rO88792 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F11rO88792 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
F11rO88792 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F11rO88792 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
F11rO88792 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
F11rO88792 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F11rO88792 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
F11rO88792 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F11rO88792 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
F11rO88792 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F11rO88792 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F11rO88792 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F11rO88792 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
F11rO88792 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
F11rO88792 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
F11rO88792 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
F11rO88792 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
F11rO88792 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
F11rO88792 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
F11rO88792 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
F11rO88792 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F11rO88792 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
F11rO88792 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
F11rO88792 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
F11rO88792 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
F11rO88792 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
F11rO88792 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
F11rO88792 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
F11rO88792 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F11rO88792 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F11rO88792 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
F11rO88792 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
F11rO88792 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F11rO88792 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
F11rO88792 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F11rO88792 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F11rO88792 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F11rO88792 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
F11rO88792 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
F11rO88792 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F11rO88792 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F11rO88792 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F11rO88792 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
F11rO88792 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
F11rO88792 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F11rO88792 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
F11rO88792 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
F11rO88792 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F11rO88792 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
F11rO88792 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
F11rO88792 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F11rO88792 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
F11rO88792 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
F11rO88792 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
F11rO88792 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
F11rO88792 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
F11rO88792 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
F11rO88792 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F11rO88792 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
F11rO88792 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
F11rO88792 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
F11rO88792 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
F11rO88792 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
F11rO88792 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F11rO88792 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F11rO88792 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
F11rO88792 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
F11rO88792 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
F11rO88792 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
F11rO88792 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
F11rO88792 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
F11rO88792 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F11rO88792 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F11rO88792 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F11rO88792 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
F11rO88792 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.51
F11rO88792 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
F11rO88792 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
F11rO88792 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F11rO88792 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
F11rO88792 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
F11rO88792 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F11rO88792 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
F11rO88792 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
F11rO88792 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F11rO88792 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F11rO88792 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F11rO88792 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
F11rO88792 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
F11rO88792 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F11rO88792 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
F11rO88792 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
F11rO88792 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
F11rO88792 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
F11rO88792 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
F11rO88792 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms