Protein–RNA interactions for Protein: O54965

Rnf13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf13O54965 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rnf13O54965 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rnf13O54965 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rnf13O54965 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rnf13O54965 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf13O54965 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf13O54965 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf13O54965 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf13O54965 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf13O54965 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf13O54965 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf13O54965 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf13O54965 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf13O54965 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Rnf13O54965 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf13O54965 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf13O54965 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf13O54965 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Rnf13O54965 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf13O54965 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf13O54965 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Rnf13O54965 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf13O54965 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf13O54965 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf13O54965 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf13O54965 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf13O54965 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms