Protein–RNA interactions for Protein: O35912

Emp3, Epithelial membrane protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emp3O35912 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Emp3O35912 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Emp3O35912 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Emp3O35912 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Emp3O35912 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Emp3O35912 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emp3O35912 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Emp3O35912 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Emp3O35912 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Emp3O35912 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Emp3O35912 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Emp3O35912 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Emp3O35912 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Emp3O35912 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Emp3O35912 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Emp3O35912 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Emp3O35912 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emp3O35912 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emp3O35912 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Emp3O35912 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Emp3O35912 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Emp3O35912 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Emp3O35912 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Emp3O35912 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Emp3O35912 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Emp3O35912 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Emp3O35912 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Emp3O35912 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Emp3O35912 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Emp3O35912 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Emp3O35912 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Emp3O35912 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Emp3O35912 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Emp3O35912 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Emp3O35912 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Emp3O35912 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms