Protein–RNA interactions for Protein: O35473

C1d, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1dO35473 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
C1dO35473 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1dO35473 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1dO35473 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
C1dO35473 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
C1dO35473 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
C1dO35473 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C1dO35473 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1dO35473 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1dO35473 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C1dO35473 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1dO35473 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1dO35473 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1dO35473 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C1dO35473 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1dO35473 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C1dO35473 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1dO35473 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C1dO35473 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C1dO35473 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
C1dO35473 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C1dO35473 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C1dO35473 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1dO35473 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C1dO35473 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
C1dO35473 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1dO35473 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1dO35473 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C1dO35473 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1dO35473 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C1dO35473 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
C1dO35473 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
C1dO35473 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C1dO35473 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C1dO35473 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
C1dO35473 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
C1dO35473 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
C1dO35473 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1dO35473 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1dO35473 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1dO35473 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C1dO35473 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
C1dO35473 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1dO35473 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1dO35473 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C1dO35473 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
C1dO35473 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1dO35473 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1dO35473 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
C1dO35473 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C1dO35473 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1dO35473 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C1dO35473 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1dO35473 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C1dO35473 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
C1dO35473 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
C1dO35473 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
C1dO35473 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C1dO35473 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
C1dO35473 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C1dO35473 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1dO35473 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
C1dO35473 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
C1dO35473 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
C1dO35473 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1dO35473 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C1dO35473 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C1dO35473 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C1dO35473 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C1dO35473 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C1dO35473 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C1dO35473 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1dO35473 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C1dO35473 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
C1dO35473 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1dO35473 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C1dO35473 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C1dO35473 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C1dO35473 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1dO35473 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1dO35473 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1dO35473 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
C1dO35473 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C1dO35473 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1dO35473 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C1dO35473 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1dO35473 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1dO35473 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C1dO35473 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1dO35473 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1dO35473 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
C1dO35473 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1dO35473 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
C1dO35473 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1dO35473 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
C1dO35473 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C1dO35473 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C1dO35473 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C1dO35473 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C1dO35473 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms