Protein–RNA interactions for Protein: O35454

Clcn6, Chloride transport protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn6O35454 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Clcn6O35454 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Clcn6O35454 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clcn6O35454 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Clcn6O35454 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Clcn6O35454 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Clcn6O35454 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Clcn6O35454 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn6O35454 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn6O35454 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Clcn6O35454 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Clcn6O35454 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Clcn6O35454 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Clcn6O35454 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Clcn6O35454 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Clcn6O35454 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Clcn6O35454 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Clcn6O35454 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Clcn6O35454 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Gm43936-201ENSMUST00000203987 490 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Clcn6O35454 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Clcn6O35454 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Clcn6O35454 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms