Protein–RNA interactions for Protein: O35368

Ifi203, Interferon-activable protein 203, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi203O35368 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Ifi203O35368 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Ifi203O35368 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ifi203O35368 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ifi203O35368 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ifi203O35368 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ifi203O35368 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ifi203O35368 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ifi203O35368 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi203O35368 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi203O35368 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ifi203O35368 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ifi203O35368 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ifi203O35368 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ifi203O35368 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ifi203O35368 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ifi203O35368 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ifi203O35368 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ifi203O35368 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ifi203O35368 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ifi203O35368 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ifi203O35368 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ifi203O35368 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ifi203O35368 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ifi203O35368 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms