Protein–RNA interactions for Protein: O35066

Kif3c, Kinesin-like protein KIF3C, mousemouse

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3cO35066 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Kif3cO35066 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Kif3cO35066 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Kif3cO35066 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kif3cO35066 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kif3cO35066 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Kif3cO35066 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kif3cO35066 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kif3cO35066 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kif3cO35066 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kif3cO35066 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kif3cO35066 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kif3cO35066 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kif3cO35066 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kif3cO35066 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Kif3cO35066 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kif3cO35066 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kif3cO35066 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kif3cO35066 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Kif3cO35066 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kif3cO35066 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif3cO35066 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Kif3cO35066 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kif3cO35066 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kif3cO35066 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kif3cO35066 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Kif3cO35066 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kif3cO35066 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kif3cO35066 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kif3cO35066 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Kif3cO35066 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kif3cO35066 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kif3cO35066 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Kif3cO35066 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms